Alle floder i Cuba er korte og meget knappe. Desuden flyder det meste af det i det caribiske havs farvande.
Almandares -floden
Geografisk er flodlejet placeret i den vestlige del af øen og har en samlet længde på 47 kilometer. Kilden til floden er Lake Sequito, der ligger i en højde af 225 meter over havets overflade. Derefter krydser Almandares landet i en nordvestlig retning og strømmer ud i farvandet i Florida -strædet (nær byen Havana).
Flodens farvande er meget stærkt forurenet. Dette lettes af mange virksomheder - bryggerier, byggeværker, gaslagre og papirfabrikker.
Almandarem Park (hovedstadens bypark) ligger på flodbredden.
Kauto -floden
Cauto passerer gennem landene i provinserne Santiago de Cuba og Granma. Desuden er det øens længste flod - flodbundens samlede længde er 343 kilometer.
Kilden til Kauto er den sydøstlige del af øen, Sierra Maestra -bjergene. Derefter krydser floden landet i nordvestlig retning for at ende i farvandet i Guacanayabo -bugten (nær byen Manzanillo).
Floden er kun sejlbar i det lavere forløb - de sidste 110 kilometer før sammenløbet. Floden er stærkt forurenet og kan ikke bruges som kilde til drikkevand.